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生物标本和DNA产量的关系
来源:www.nczhisheng.com 发表时间:2020-01-07

  遗传流行病学领域出现了一场革命,这些平台能够在单个个体中对数百万个单核苷酸多态性(snp)进行基因分型,基因分型分析中DNA的质量影响基因分型的成功率,并可能影响结果,今天小编将去介绍生物标本和DNA产量的关系。

生物标本和DNA产量的关系

  高通量基因分型分析(如全基因组扫描)和更敏感的基因分析(包括测量基因甲基化或体细胞突变)需要高产量的DNA,我们假设基因组分析的DNA可用性受生物样本类型(全血、浅黄色外套、浅黄色外套/红细胞)、DNA提取方法以及收集和储存中的变化的影响。

  在本提案中,DNA可用性或适合基因分型是根据NCI核心基因分型设施(CGF)用作浓度大于25 ng/ml且总产量至少为20 mg的样本的标准来定义的,检测用桥根提取法、龙胆提取法或酚氯仿提取法从棕黄色皮毛标本中提取的DNA的产率。

  DNA的可用性将通过检查从一小瓶浅黄色外套样本中获得的DNA的平均量(总量、浓度)来评估,该平均量是通过使用纳米滴分析来估计的。

  

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